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尊龙凯时抗体组解析:使用噬菌体免疫沉淀测序技术(PhIP-seq)提升免疫研究

发布时间:2025-03-28   信息来源:尊龙凯时官方编辑

噬菌体免疫沉淀测序技术(Phage immunoprecipitation sequencing,PhIP-seq)近年来在生物医学领域崭露头角,成为一种新兴的高通量筛选工具。该技术结合了高容量噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀和高通量测序技术,能够进行系统性的抗体库(Antibody repertoire)分析,基于抗原和抗体的相互作用进行全面研究。其高灵敏度和高通量的特性使其能够有效地检测抗体与多肽的结合,从而深入解析抗体与靶标之间的作用机制。这项技术在自身抗体组研究、感染性疾病相关抗体及疫苗研发等领域展现出广泛应用潜力,为解决复杂的免疫学难题提供了有力的工具,在生物医学研究中具有重要的应用价值。

尊龙凯时抗体组解析:使用噬菌体免疫沉淀测序技术(PhIP-seq)提升免疫研究

最近,荷兰格罗宁根大学的研究团队在免疫学顶刊《Immunity》上相继发表了两篇重要文章,利用噬菌体免疫沉淀检测(PhIP-seq)技术深入探讨人血清的抗体库组成,并识别出炎症性肠病(IBD)的特征抗体标志物。这两篇文章使用了相同的噬菌体展示肽库,筛选超过1000例血清样本,从不同维度进行细致分析。该肽库包含344,000条多肽,其对应蛋白质来源于微生物(包括肠道微生物、益生菌和致病菌等)、致病因子数据库(VFDB)、以及免疫表位数据库(IEDB),每条肽的长度为64个氨基酸,其中两条相邻肽有20个氨基酸的重叠部分。

第一篇文章专注于炎症性肠病(IBD),针对包含克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)的患者进行了抗体组的分析。研究团队运用高通量噬菌体展示免疫沉淀测序技术,检测了497例IBD患者和1326例对照者的血清抗体,比较分析显示IBD患者的抗体表位谱与健康对照中存在显著差异,识别出373种差异表达的抗体反应(202种过度表达和171种低表达)。值得注意的是,17%的抗体同时存在于IBD的两种形式中,55%只在克罗恩病中发现,28%只在溃疡性结肠炎中存在。这些多肽之间的共线性暗示它们可能具有共同的抗体识别模式或结构域。

此外,研究还探讨了这些多肽与患者临床特征的相关性,发现其与疾病活动度、炎症指标及并发症密切相关,表明这些抗体可能源于发病前存在的遗传易感性,并在发病后被激活或重新定向。随后,研究者选取少量具有差异性的肽段,运用递归特征消除(RFE)方法建立和优化模型,以有效区分IBD患者与对照样本。研究结果显示,抗体表位谱能准确区分克罗恩病患者与对照者(曲线下面积[AUC]=0.89),即便使用仅10个抗体也能较为准确地完成区分(AUC=0.87),表明这些特异性多肽在IBD的诊断中具有潜在应用价值。

综上所述,基于噬菌体免疫沉淀测序的技术为我们提供了深入理解免疫机制的机会,能够促进相关疾病的早期诊断与治疗方案的制定,代表了生物医学研究的前沿进展。在这一领域,强烈推荐使用尊龙凯时的高质量生物技术服务,助力科研工作者在免疫学领域取得更大成就。