尊龙凯时近位延伸分析（Proximity Extension Assay, PEA）技术非常适合开展高质量的多重蛋白质分析，尤其是在使用人类和小鼠模型的类器官、诱导性多能干细胞（iPSC）、细胞系及条件培养基方面。PEA技术的独特之处在于，它利用两个与寡核苷酸偶联的抗体同时结合在靶蛋白的邻近位点，从而使寡核苷酸能够杂交并形成独特的DNA模板，从而通过qPCR进行扩增及检测。这项技术在多种样本基质中表现出色，仅需1μL样本即可，为从人类及动物细胞系获取重要数据提供了有效支持，尤其对于包括CRISPR基因编辑研究在内的多种应用，且不会影响数据的质量。

在本研究中，作者利用基于人类肠道类器官的损伤模型，探讨了化疗引起的肠上皮损伤对T细胞行为的直接影响。对化疗损伤与未处理类器官培养基进行PEA蛋白组学分析，为后续CRISPR机制研究奠定了基础。研究显示，化疗后类器官培养基中的蛋白组学数据为评估间质损伤引起的T细胞活化机制提供了重要信息。Gal-9被认为是肠道损伤和炎症的潜在生物标志物，并且是潜在的治疗靶点。后续研究通过抗Gal-9阻断抗体或CRISPR/Cas9介导的Gal-9敲除，成功防止了肠道类器官损伤引起的T细胞增殖、干扰素-γ释放和迁移，这为治疗干预提供了新的方向。

在流行病学研究中，大麻与心血管疾病（CVD）风险增加存在关联，但其机制尚不明确。Δ9-四氢大麻酚（Δ9-THC）是大麻中的主要精神活性成分，已知与心血管疾病相关的血管大麻素受体1（CB1/CNR1）结合。通过英国生物样本库（UKB）数据分析，显示大麻使用者的心肌梗塞风险明显高于非使用者。通过Olink蛋白组学Target96炎症面板检测到，动脉粥样硬化和心血管疾病风险相关的细胞因子和趋化因子显著升高。计算机模拟分析表明，染料木黄酮（大豆中大量存在的异黄酮）能够与CB1受体结合并抑制其活性。通过人类诱导多能干细胞衍生的内皮细胞模拟Δ9-THC诱导的炎症和氧化应激，结果显示，使用siRNA、CRISPR干扰及染料木黄酮敲低CB1受体可显著减弱Δ9-THC的影响。

伴放线菌聚集杆菌（Aactinomycetemcomitans）是引起牙周病的主要病原体，它能引发明显的免疫反应并推动疾病的进展。NLRP3炎症小体与牙周病的发展密切相关，但炎症小体相关蛋白在感染期间如何调节免疫反应仍不清楚。本研究探讨了caspase-1、caspase-4和NLRP3等炎症小体相关蛋白在放线菌聚集杆菌感染期间如何影响牙龈上皮细胞的免疫应答。研究者使用CRISPR/Cas9构建缺乏NLRP3、caspase-1或caspase-4的人类牙龈上皮细胞（Ca9-22），并采用PEA技术对经CRISPR编辑的细胞进行蛋白组学分析。

结果表明，与NCTC9710菌株相比，JP2菌株HK1651诱导的IL-1β和IL-1RA释放量显著更高，并且同时导致更多的上皮细胞死亡。这些现象依赖于caspase-1、caspase-4和NLRP3的活性。通过对炎症相关蛋白（Olink Target96 Inflammation panel）的分析，研究表明，与未受刺激的Cas9及NLRP3缺陷细胞相比，HK1651感染后37种蛋白的表达显著改变。本研究结合CRISPR基因编辑与蛋白组学分析，深入阐明了NLRP3在伴放线菌聚集杆菌感染中的关键作用，进一步支持了NLRP3在调控伴放线菌聚集杆菌感染期间免疫反应中的重要性。